Российская Информационная Сеть
English   Контакты
Политика  Общество  Экономика  Деловые  Наука  Hi-Tech  Культура  Шоу-бизнес  Спорт  Происшествия  Криминал  Скандалы  Пикантные  Зарубежные  ИноСМИ
ТОП-дайджест  Хроника  Эксклюзив  Фоторепортажи  Личное мнение  Погода  Комментарии  Поиск  RSS  Интернет-радио  
 Топ 20 сегодня Топ 20 сегодня 
Минкультуры отозвало прокатное удостоверение у фильма "Смерть Сталина"
"Нелюбовь" Звягинцева номинировали на "Оскар"
Второй турецкий военный погиб в АфринеВторой турецкий военный погиб в Африне
Националисты устроили митинг у Конституционного суда в Киеве из-за закона о госязыкеНационалисты устроили митинг у Конституционного суда в Киеве из-за закона...
В США объявили угрозу цунами после сильного землетрясения у берегов АляскиВ США объявили угрозу цунами после сильного землетрясения у берегов Аляски...
В аэропорту Ганновера подрались курды и сторонники ЭрдоганаВ аэропорту Ганновера подрались курды и сторонники Эрдогана
Минкомсвязь смягчила законопроект о регулировании интернет-трафикаМинкомсвязь смягчила законопроект о регулировании интернет-трафика
Суд арестовал подозреваемого в нападении на школу в Улан-УдэСуд арестовал подозреваемого в нападении на школу в Улан-Удэ
Россия ведет переговоры о продаже С-400 на Ближний Восток и в Юго-Восточную АзиюРоссия ведет переговоры о продаже С-400 на Ближний Восток и в Юго-Восточную...
Трамп продлил работу правительства на две неделиТрамп продлил работу правительства на две недели
далее топ дня...
 Фотожурнал: фото-топ за месяц, галерея всех фото Фотожурнал 
 Новости партнеров
 Топ новости разделов сегодня Топ новости разделов 
Минкультуры отозвало прокатное удостоверение у фильма "Смерть Сталина"Минкультуры отозвало прокатное удостоверение у фильма "Смерть Сталина"
В Киеве объяснили снижение транзита российского газа через УкраинуВ Киеве объяснили снижение транзита российского газа через Украину
В Госдуме предложили ограничить регистрацию детей в соцсетяхВ Госдуме предложили ограничить регистрацию детей в соцсетях
Россия ведет переговоры о продаже С-400 на Ближний Восток и в Юго-Восточную АзиюРоссия ведет переговоры о продаже С-400 на Ближний Восток и в Юго-Восточную...
Минкомсвязь смягчила законопроект о регулировании интернет-трафикаМинкомсвязь смягчила законопроект о регулировании интернет-трафика
Пять мирных жителей ранены из-за обстрела силовиков, заявили в ДНРПять мирных жителей ранены из-за обстрела силовиков, заявили в ДНР
В аэропорту Ганновера подрались курды и сторонники ЭрдоганаВ аэропорту Ганновера подрались курды и сторонники Эрдогана
Националисты устроили митинг у Конституционного суда в Киеве из-за закона о госязыкеНационалисты устроили митинг у Конституционного суда в Киеве из-за закона...
Если вы уже слушаете новогодние песни, то у нас для вас плохая новостьЕсли вы уже слушаете новогодние песни, то у нас для вас плохая новость
В Госдуму внесли проект о запрете на вход для журналистов американских СМИ-иноагентовВ Госдуму внесли проект о запрете на вход для журналистов американских...
далее...
 Личное мнение Личное мнение 

 Новости о знаменитостях Знаменитости 
Новость: 18 августа 14:54: Слухи о закрытии передачи «Давай поженимся»Слухи о закрытии передачи «Давай поженимся»

Новость: 29 июля 16:01: Звездная Coca-Cola - самый яркий летний хит на Europa Plus LiveЗвездная Coca-Cola - самый яркий летний хит на Europa Plus Live


 Заплатим за ваше мнение!
Получайте до 1,5 долларов за каждую заполненную анкету!



 Новости науки и техники Новости науки и техники 
11 августа, 16:08

Расшифровка ДНК подешевела до $50 тыс

Новости науки и техники: Расшифровка ДНК подешевела до $50 тыс
Опубликован самый дешевый человеческий геном. Чтобы прочитать генетический код профессора из Стэнфорда, потребовались $50 тыс., новая технология, русский аспирант и около месяца работы.

Возможно, вскоре расшифровку ДНК начнут заказывать страховые компании при работе с клиентами.

Всего шесть лет назад был опубликован опорный геном человека, на считывание которого ушло 13 лет и около $300 млн. С тех пор темпы секвенирования стремительно росли, а стоимость считывания падала. В среднем десятикратно за полтора года.

Гонка с препятствием

Тем не менее до сих пор считано меньше десятка человеческих геномов. Большинство специалистов сходятся в том, что расшифровка станет по-настоящему массовой, а персональная медицина - доступной лишь тогда, когда стоимость человеческого генома упадет до нескольких тысяч долларов. Фонд XPrize даже учредил премию $10 млн команде, которая секвенирует сто человеческих геномов меньше чем за десять дней и по $10 тыс. каждый.

Если предположить, что стоимость секвенирования будет падать теми же темпами, ждать вручения премии осталось лишь несколько лет, тем более что никаких принципиальных ограничений на этом пути не видно. Первыми достичь заветной черты ученые и биотехнологические компании пытаются с помощью примерно полудюжины разных технологий, самые известные из которых развивают компании Applied Biosystems, Helicos, Illumina и Roche.

Одним из главных препятствий тем не менее остается стоимость реактивов, необходимых для первого шага секвенирования. Он необходим, чтобы многократно размножить молекулу ДНК и затем разрезать ее на короткие фрагменты. После этого можно прочитать короткие фрагменты кода и сложить из многочисленных и, что самое главное, случайным образом перекрывающихся кусочков полную последовательность нуклеотидов. На сегодняшний день этот первый шаг обходится примерно в $100 тыс. на геном.

Достаточно одной нарезки

В начале 2000-х годов группа американских ученых начала развивать принципиально иной подход, так называемое одномолекулярное секвенирование - SMS, Single Molecule Sequencing (часто к акрониму добавляют строчную буковку t - true, "настоящее"). Сейчас его развивает компания Helicos, одним из основателей которой стал разработчик tSMS, профессор Стэнфордского университета Стивен Квейк.

Здесь без разрезания на мелкие кусочки тоже не обойтись, однако процесс не требует самого дорогостоящего этапа - размножения исходной ДНК. Чтобы превратить этот набор фрагментов в связный текст генетического кода, приходится полагаться уже не на случайное перекрытие повторяющихся фрагментов, а на их схожесть с опорным геномом.

Авторы методики сравнивают этот процесс со сбором пазла, при котором приходится постоянно подглядывать в картинку на его обложке. Понятно, что этот метод не мог появиться до 2003 года, когда "картинка" - опорный геном - была опубликована. Авторы методики надеются, что избавление от дорогостоящего размножения генома и способность разом определить геномную последовательность нескольких молекул сделают такое секвенирование доступным. Более того, официально объявленная цель компании Helicos - $1000 за геном.

С самолета на авто

До этой цели пока добраться не удалось, однако в понедельник в журнале Nature Biotechnology появилась статья, описывающая секвенирование по этой технологии полного человеческого генома, которое обошлось в $50 тыс. (включая все реактивы). Занял процесс меньше месяца, а в работе участвовали всего три человека - ведущий автор публикации Стивен Квейк, его аспирант, выпускник московского Физтеха Дмитрий Пушкарев и их сотрудница Норма Нефф.

В сравнении с $300 млн, 13 годами и многонациональным коллективом из нескольких сотен человек прогресс налицо. Иными словами, раньше был процесс, который стоил как Boeing 747, требовал усилий коллектива, который занял бы половину "летающего слона", и использовал машины с него размером. Теперь получается нечто по цене не самого дорогого автомобиля с коллективом, который с запасом бы в нем уместился. Правда, сама установка размером, формой и в чем-то даже дизайном напоминает вовсе не автомобиль, а средней руки холодильник.

Умный UMKA

Титул обладателя самого дешевого расшифрованного генома, признают ученые, теперь носит сам Квейк, хотя в статье донор генома назван лишь "белым мужчиной европейского происхождения". Его последовательность ДНК теперь опубликована и доступна всем желающим - за успех приходится платить. По словам ученого, коллеги-медики уже принялись внимательно изучать его и без конца таскают на обследования и анализы.

Заглянув в статью, несложно догадаться, что когда-то российский физик Дмитрий Пушкарев занимался разработкой алгоритма, превращающего набор бессмысленных фрагментов ДНК в полноценный геном. Алгоритм этот носит милое любому соотечественнику имя UMKA. Кстати, именно UMKA - главная соль работы, именно ему посвящена львиная доля статьи, и с его помощью ученые надеются повысить надежность считывания.

Покрытие и точность генома, полученного с помощью новой технологии, не 100-процентные, однако идеального покрытия и безошибочности считывания не дает ни один метод. Более того, многим из них UMKA в союзе с tSMS может дать немалую фору.

Новая надежда

Соревнование продолжается. Например, та же Applied Biosystems еще в феврале обещала летом начать коммерческое считывание геномов по $48 тыс. А год назад одна из американских компаний даже начала принимать предварительные заказы на расшифровку по $5 тыс. за геном. Правда, публикаций с результатами пока нет, так что, чего удалось добиться разработчикам, непонятно.

Тем не менее новый результат оставляет надежду, что уже на нашем веку, и довольно скоро, секвенирование генома станет чем-то обыденным. Может, исследования на генетическую предрасположенность к тому или иному заболеванию скоро даже будет покрывать стандартная медицинская страховка. Главное, чтобы страховые компании не начали учитывать результаты этих исследований при расчете своих премий.
[Читать все комментарии] [Напечатать новость]
http://www.infox.ru
  Комментарии к новости 
[Добавить комментарий]

Комментариев к этой новости пока нет. Добавьте первым свой комментарий!
[Добавить комментарий]
 Хроника новостей: Новости науки и техники Хроника новостей 
Россия ведет переговоры о продаже С-400 на Ближний Восток и в Юго-Восточную Азию

23 января 07:04
Источник сообщил о планируемой утилизации двух крупнейших в мире российских подлодок

19 января 05:04
Источник сообщил о планируемой утилизации двух крупнейших в мире подлодок

19 января 04:04
Автомобили проекта "Кортеж" появятся в свободной продаже в 2019 году

16 января 21:04
США собираются увеличить количество ядерного оружия для "сдерживания" России

13 января 00:04
Пентагон уличили в искажении информации о подлодках нового поколения

11 января 07:04
NI рассказало об американском конкуренте российскому "Спрут-СД"

11 января 02:04
США планируют создать новую ядерную боеголовку для сдерживания России, пишут СМИ

10 января 03:04
Корабль "Союз" с экипажем пристыковался к МКС

19 декабря 12:04
На Дальнем Востоке появится новая армия, сообщили СМИ

18 декабря 09:04
От МКС отстыковался "Союз МС-05" с тремя космонавтами

14 декабря 09:04
В Стокгольме наградили лауреатов Нобелевской премии

10 декабря 22:04
Спутник "Метеор-М" не вышел на целевую орбиту

28 ноября 13:04
На Восточном прошел второй пуск в истории космодрома

28 ноября 10:04
РН "Союз" со спутником взлетела с космодрома Восточный

28 ноября 09:04
Госкомиссия разрешила второй запуск РН с космодрома Восточный

28 ноября 08:04
Российские специалисты отправились в район поисков аргентинской подлодки

28 ноября 06:04
Пентагон заявил об "опасном" перехвате Су-30 самолета США

28 ноября 04:04
Вошедший в Черное море американский эсминец направляется в Одессу

28 ноября 01:04
Турция успокоила, что С-400 не опасны для НАТО

27 ноября 20:04
Как быстро похудеть: 3 важных фактора

10 ноября 09:25
МВД планирует ввести новые экзамены для водителей.

7 ноября 09:23
Россия ближайшем будущем будет развивать ядерные силы и высокоточное оружие.

31 октября 10:34
Российская армия получила ещё один полк С-400

26 октября 12:44
Российские школьники собрали все золотые медали чемпионата JuniorSkills

19 октября 16:40
Россия празднует День Ксмических войск

4 октября 08:38
Крымский мост защитят от диверсантов

3 октября 08:07
Новое российское оружие способно выключать электронику НАТО на расстоянии

2 октября 10:52
Россия лишилась опасного оружия

28 сентября 08:41
Виктория Дайнеко пожаловалась на бывшего мужа

27 сентября 10:51
 1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11  12  13  14  15  16  17  18  19  20  21  22  23  24  25 >> 938
 Главная новость дня Главная новость дня 
Минкультуры отозвало прокатное удостоверение у фильма "Смерть Сталина"
 
 Эксклюзив Эксклюзив 
Пора ли продавать акции Apple? Пора ли продавать акции Apple?
 
  Топ новостей Опросы 
 Фоторепортажи: новости с подборкой фотографий Фоторепортажи 
68-летняя Пугачева показала свои морщины (фото)
В Кёльне около 100 человек застряли на канатной дороге (фото)
Астрологи назвали причину смерти Олега Яковлева
Пугачева затмила невесту Никиты Преснякова (фото, видео)
В Кёльне около 100 человек застряли на канатной дороге (фото)
 Новости партнеров
 Новости дня Новости дня 
 
  Copyright © RIN 2000-
* Обратная связь
Контактная информация  
Политика  Общество  Экономика  Деловые  Наука  Hi-Tech  Культура  Шоу-бизнес  Спорт  Происшествия  Криминал  Скандалы  Пикантные  Зарубежные  ИноСМИ