Учёные из Калифорнийского университета в Сан-Франциско под руководством Мери Окори и Ши Дж. Эндрюса предложили новый способ оценивать наследственный риск болезни Альцгеймера, который одинаково хорошо работает для людей разного происхождения. Работа опубликована в журнале Alzheimer's & Dementia.
Болезнь Альцгеймера - прогрессирующее заболевание мозга, при котором постепенно разрушаются память и мышление. Чтобы заранее понять, у кого риск выше, исследователи используют так называемые полигенные оценки риска. Это инструмент, который суммирует крошечный вклад тысяч генетических вариаций по всему геному человека и выдаёт общую цифру унаследованного риска.
Для построения таких оценок нужны полногеномные исследования ассоциаций - масштабные проекты, где сканируют ДНК тысяч людей и ищут мелкие генетические различия, связанные с болезнью. Исторически в этих базах данных преобладали люди европейского происхождения. Ещё в 2016 году было показано, что оценки, построенные на европейских данных, заметно теряют точность при применении к другим группам. Дело в том, что генетика человека немного различается между популяциями, поэтому "европейский" тест плохо предсказывает риск, например, у выходцев из Африки или Азии.
Чтобы исправить это, учёные собрали генетические данные сотен тысяч людей европейского, африканского, восточноазиатского, карибского латиноамериканского происхождения, а также так называемых смешанных американцев - групп, чья родословная сочетает индейские, европейские и африканские корни. На этой основе построили три типа оценок риска: только по европейским данным, объединённую по всем группам и перекрёстную - сложную статистическую модель, которая анализирует данные разных популяций совместно и корректирует вес каждой генетической вариации с учётом общих эффектов.
Проверяли модели на двух больших группах пациентов в США. В анализ включали поправки на возраст, пол и ген APOE - известную вариацию, которая сама по себе сильно повышает риск Альцгеймера.
Результат оказался наглядным. Оценка, построенная только на европейских данных, хорошо работала для европейцев, хуже - для смешанных американцев, а у людей африканского происхождения вообще не предсказывала риск болезни. Перекрёстная оценка показала лучшую точность для всех групп. У участников африканского происхождения более высокий балл по этой шкале был связан с ростом шансов на диагноз Альцгеймера на 71% по сравнению с базовым уровнем. Это статистическая связь, которая сама по себе не доказывает причинность.
Новая оценка предсказывала не только диагноз, но и объективные признаки болезни: худшие результаты тестов на память, язык и исполнительные функции (навыки планирования, самоконтроля и гибкого мышления), а также биомаркеры. У людей с высоким генетическим риском в спинномозговой жидкости чаще был снижен уровень белка амилоид-бета 42 - это указывает на то, что белок слипается в мозге в вредные бляшки. По данным вскрытий и томографии, у обладателей самых высоких баллов чаще встречались тяжёлые формы поражения мозговой ткани.
Авторы оговаривают ограничения. В проверочной части не были представлены выходцы из Южной и Восточной Азии, поэтому о точности модели для них судить нельзя. Все участники жили в США - неизвестно, сохранится ли результат в других странах с иным образом жизни и средой. Наконец, такие оценки объясняют лишь скромную долю общего риска: возраст, пол, редкие гены, питание и физическая активность тоже влияют на то, разовьётся ли болезнь. Взаимодействие среды и генов в этой работе не изучалось.

Комментарии
0Комментариев пока нет. Начните обсуждение.